L'utilisation de semences de ferme suppose comme préalable un nettoyage complet des grains via un séparateur. Ensuite, le traitement appliqué dépend des maladies visées (charbon, carie, fusariose, piétin échaudage) et de l'espèce à protéger.
Le blé dur, par exemple, est très sensible à Microdochium responsable des fontes de semis. Par ailleurs, la lutte contre les insectes foliaires (pucerons, cicadelles) ou du sol (taupin, zabre) implique d'adjoindre une spécialité efficace contre le ravageur visé. Certains fabricants proposent des produits complets.
Un travail de qualité suppose d'être capable d'enrober les semences de manière homogène et de respecter la santé des applicateurs en utilisant des équipements de protection individuelle.