Un accord-cadre relatif à l'accompagnement des agriculteurs dans les changements nécessaires à la protection pérenne des ressources en eau a été signé, le 17 janvier 2014, entre l'agence de l'eau Seine-Normandie et les six fédérations régionales des coopératives agricoles du bassin.
A l'horizon de 2015, l'objectif est d'assurer la protection des captages prioritaires d'eau potable, tout en « prenant en compte les réalités environnementales, sociales et économiques des producteurs de l'eau et des filières agricoles ». 500 coopératives sont impliquées dans ce dispositif, ce qui représente les trois quarts des agriculteurs du bassin versant.
Les collectivités entendent s'appuyer sur la technicité et le dynamisme économique des coopératives pour construire ensemble la protection de l'eau potable et faire évoluer les systèmes agricoles vers des composantes environnementales, sans nuire aux intérêts économiques et sociaux des filières.