Cooperl Arc Atlantique confirme dans un communiqué du 8 octobre 2014 « la fin de l'enquête judiciaire portant sur les méthodes d'analyse de la présence de salmonelles dans certains de nos produits avant novembre 2012. Six collaborateurs Cooperl ainsi que la société Cooperl représentée par son président sont cités dans la perspective d'un procès prévu le 24 février 2015 ».
La coopérative rejette « à nouveau avec force les allégations de fraude et d'escroquerie qui sont totalement contraires à nos valeurs et à l'éthique de notre coopérative. La procédure judiciaire suit son cours. Elle a pour l'instant été menée exclusivement à charge et sans égard pour les droits de la défense. Nous allons enfin avoir accès à l'intégralité des pièces du dossier et serons en mesure de préparer au mieux notre défense. »