La directive nitrates modifie le calcul des capacités de stockage des effluents d'élevage dans les zones vulnérables. Pour les éleveurs qui pensent que leurs capacités de stockage sont insuffisantes ou risquent de l'être, un délai de deux ans au maximum (jusqu'au 30 septembre 2016) pour faire les travaux de mise aux normes peut être accordé.
Il faut en faire la demande à la DDT(M) avant le 1er novembre 2014, via le formulaire de déclaration d'engagement d'un projet d'accroissement des capacités de stockage des effluents d'élevage. Dans la plupart des départements, les chambres d'agriculture proposent des diagnostics personnalisés.