Hausse des températures et pluies durant la floraison font courir un risque de fusariose aux blés durs et aux variétés de blés sensibles. Même si les meilleurs moyens de lutte demeurent le choix du précédent et le travail du sol, certains fongicides parviennent à 70 % d'efficacité.
En cas de traitement unique, la spécialité doit être positionnée dès la sortie des premières étamines.
En cas d'orages à répétition, il est possible d'encadrer la floraison par deux demi-doses espacées d'une dizaine de jours. Le prothioconazole, le tébuconazole, le metconazole font partie des matières actives les plus performantes.